《萌萌军团》英雄主要有6个阵营，其中包括红莲帝国，冰川流放者，七海联邦，狼心部落，
重启机，咒缚者;他们相互克制，具体克制关系如下：
每个部落都有一段传奇的故事，小面由我来为大家介绍各个部落以及代表英雄。
红莲帝国：红莲会(异教徒)是由一群自称为先知的人成立的松散组织。组织成员依靠女神与他们分享的梦境维系彼此，共同为饱受战火蹂躏之地恢复秩序与生活。
红莲帝国认为他们不过是些江湖骗子,要破坏他们试图通过收集远古圣物复活女神的计划。
代表英雄：牧羊人、扎赫拉、再生师、红莲王子、赛娜
冰川流放者：冰川流放者(突袭者)被迫到气候温暖的地方寻找食物与谋生机会，但语言和当地的排外情绪使他们陷入了困境。就在快要饿死之际，为了获取食物，继续生存下去，冰川流放者走上了掠夺之路。他们经常被误认为是肆意杀戮与偷窃的劫掠者，但这些流放者只坚持夺取自己所需之物，而且绝不能伤害无辜的人。
代表英雄：尤弥尔、寒冰女巫
狼心部落：狼心部落(强盗)依然记得战争爆发前世界的模样森林茂密，各地安宁。从那时起，他们一直努力不懈地保护自然环境，以及将贪婪的红莲贵族手中的资源重新分配给工人。他们是在整个帝国范围内活跃的秘密组织。
代表英雄：龙骑士、丽莎、小约翰
七海联邦：七海恶徒(海盗)通过走私和私酒买卖开拓了自己的市场。他们的主要对手是管辖整个七海贸易的七海联邦。海上飘扬着这群海盗的旗帜，激起了七海联邦心中的恐惧和敌意，也在民众心中激起了高昂的情绪与希望。
代表英雄：学者、海上恶霸、莫雷
咒缚者：黑暗誓约者(受诅咒者)居住在黑暗王国。这是一片烟雾笼罩的荒原，太阳不过是绯红天空中的一点红斑。他们不能轻易死去,但他们必须吸取他人的生命能量才能生存下去。帝国的孩子要是不听话他们的父母就会讲述黑暗誓约者的传说,吓唬他们黑暗誓约者对喀俄涅女王俯首称臣，他们的首都位于卡尔马岛。
代表英雄：亚柔、乌鸦、艾可
重启机：
重启机(机器)是在自动机大战中幸存下来并在社会中重新立足的战争机器。它们费了许多力气去证明自己不只是杀人机器，而且还会经常收集书籍和艺术品，彰显自己对文化和美的欣赏能力。但是,它们一-旦进入了战场，就是无人能敌的机器。柴油岩石岛的恐怖工厂生产了这些机器，但没人知道是谁制造了它们，也不知道为什么要制造它们。
代表英雄：帕里斯、希尔薇、加百列
各阵营的羁绊效果，有助于提升玩家在冲击主线关卡以及在各种副本游戏中的成功率。是游戏不可忽略的一环。各种羁绊在不同的关卡有着很大的作用提升，帮助玩家能够更快的完成主线关卡的推图以及副本资源的获取
